Fluorophore and relevant filters

Fluorescent Dye
Excitation Wavelength
Emission Wavelength
 Ex-Filter Em-Filter Dichroic
CWL FWHM CWL FWHM High-Reflection High-Transmission
Alexa Fluor® 350 342 442 350 50 460 50 330-380 430-700
Alexa Fluor® 488 499 520 480 40 535 50 400-500 520-700
Alexa Fluor® 514 518 543 500 40 560 50 450-510 530-650
Alexa Fluor® 532 531 554 530 30 575 40 450-540 560-650
Alexa Fluor® 546 556 572 545 25 590 30 450-540 570-700
Alexa Fluor® 555 553 565 545 25 590 30 450-540 570-700
Alexa Fluor® 568 579 603 570 25 615 40 500-580 600-700
Alexa Fluor® 594 590 618 580 25 625 30 500-590 610-700
Alexa Fluor® 633 631 647 605 50 670 50 550-620 645-750
Alexa Fluor® 647 653 668 640 30 690 50 600-650 665-730
Alexa Fluor® 680 679 702 650 45 720 60 600-660 690-800
Alexa Fluor® 700 696 719 650 45 720 60 600-660 690-800
Alexa Fluor® 750 751 776 710 75 810 90 600-730 770-900
AmCyan 458 489 435 20 480 40 425-445 460-600
APC (Allophycocyanin) 650 660 620 60 700 75 600-650 665-730
AsRed 2 576 592 545 30 620 60 530-560 580-700
ATTO 390 392 477 395 25 460 50 350-410 430-550
ATTO 425 436 484 445 30 500 40 400-460 480-600
ATTO 465 453 507 470 40 525 50 400-480 500-600
ATTO 488 500 525 480 40 535 50 400-500 520-600
ATTO 550 553 576 545 20 590 30 450-550 570-700
ATTO 633 629 658 605 50 670 50 550-620 640-750
ATTO 647N 645 668 620 60 700 75 590-650 665-735
ATTO 680 680 700 650 45 720 60 600-670 690-800
BCECF (pH 5.2) 482 520 480 40 540 40 350-500 520-650
BCECF (pH 9.0) 502 528 480 40 540 40 350-500 520-650
Biosearch Blue 352 447 350 50 460 50 330-390 430-550
BODIPY FL/pH7.2 505 512 480 40 535 50 400-500 520-600
Brilliant Violet™ 421 408 422 395 25 430 30 350-405 415-500
Brilliant Violet™ 480 437 478 435 20 480 30 425-445 460-600
CAL Fluor® Gold 540 522 544 530 30 575 40 450-540 555-650
CAL Fluor® Orange 560 538 559 530 30 575 40 450-540 555-650
CAL Fluor® Red 590 569 591 570 25 615 40 500-580 595-700
CAL Fluor® Red 610 590 610 580 25 625 30 500-590 605-700
CAL Fluor® Red 635 618 637 605 50 670 50 550-620 645-750
Calcein 494 517 480 40 535 50 400-500 515-600
Calcium Green™-1 507 529 480 40 535 50 400-500 515-600
Cerulean 434 473 435 20 480 40 425-445 460-600
CFP 433 475 435 20 480 40 425-445 460-600
Citrine 514 529 500 20 535 30 480-505 520-650
Coumarin 360 448 350 50 460 50 330-390 430-550
Cy2™ 492 507 480 40 535 50 400-500 515-600
Cy3.5™ 578 591 570 25 615 40 500-580 595-700
Cy3™ 554 566 545 25 605 70 450-550 570-700
Cy5.5™ 675 695 650 45 720 60 600-660 690-800
Cy5™ 649 666 620 60 700 75 590-650 665-735
Cy7™ 757 781 710 75 810 90 600-730 770-900
DAPI 359 461 350 50 460 50 330-390 430-550
Di-8-ANEPPS non-ratiometric 466 630 480 30 620 60 400-495 515-700
DiA 457 586 480 30 620 60 400-495 515-700
DiD 648 670 620 60 700 75 590-650 665-735
DiI 551 569 545 25 605 70 450-550 570-700
DiO 490 506 470 40 525 50 400-480 500-600
DiR 750 782 710 75 810 90 600-730 770-900
Draq5 647 683 620 60 700 75 590-650 665-735
DsRed 559 583 545 25 605 70 450-550 570-700
DyLight 350 351 434 350 50 460 50 330-390 430-550
DyLight 405 398 420 405 20 460 50 350-410 430-550
DyLight 549 553 569 545 25 605 70 450-550 570-700
DyLight 594 593 618 580 25 625 30 500-590 605-700
DyLight 633 620 649 605 50 670 50 550-620 645-750
DyLight 649 651 673 620 60 700 75 590-650 665-735
DyLight 680 676 705 650 45 720 60 600-660 690-800
DyLight 750 751 778 710 75 810 90 600-730 770-900
DyLight 800 770 795 740 40 800 40 650-750 780-900
EBFP2 385 448 395 25 460 50 350-410 430-550
ECFP 434 477 435 20 480 40 425-445 460-600
EGFP 488 507 470 40 525 50 400-480 500-600
Emerald GFP 489 510 470 40 525 50 400-480 500-600
Eosin 525 546 500 40 560 50 450-510 530-650
Ethidium bromide 518 603 545 30 620 60 530-560 580-700
Ethidium homidimer-1/DNA 527 617 545 30 620 60 530-560 580-700
EYFP/pH 7 514 527 500 20 535 30 480-505 520-650
FAM 492 518 480 40 535 50 400-500 515-600
FITC 495 519 480 40 535 50 400-500 515-600
FlAsH-CCPFCC 511 530 500 20 535 30 480-505 520-650
Fluo-3 506 527 500 20 535 30 480-505 520-650
Fluo-4 494 516 480 40 535 50 400-500 515-600
FM™ 1-43 473 579 470 30 580 60 400-495 515-700
FM™ 4-64 508 730 510 40 730 100 450-590 605-800
Fura-2/Ca2+ - free 366 515 365 50 510 80 330-390 430-700
Fura-2/Ca2+ - saturated 336 505 335 30 510 80 320-390 430-700
FusionRed 577 604 560 40 630 75 500-570 595-750
GFP 489 511 470 40 525 50 400-480 500-600
HEX,SE 533 559 530 30 575 40 450-540 555-700
Hoechst 33258 352 455 350 50 460 50 330-390 430-700
Indo-1/Ca2+ -free 346 480 350 50 460 50 330-390 430-700
Indo-1/Ca2+ -saturated 330 400 350 40 420 40 310-380 395-550
JOE 520 548 500 40 560 50 450-510 530-650
Killer Red 585 611 560 40 630 75 500-570 595-750
Li-Cor IRDye® 680LT 674 693 650 45 720 60 600-660 690-800
Li-Cor IRDye® 800CW 778 794 740 40 800 40 650-750 780-900
Lucifer yellow 428 544 420 40 535 40 390-445 460-600
LysoTracker Blue 373 422 395 25 460 50 350-410 430-550
LysoTracker Green 501 509 470 40 525 50 400-480 500-600
LysoTracker Red 573 592 560 40 630 75 500-570 595-750
LysoTracker Yellow HCK-123 488 565 500 40 560 50 450-510 530-700
mCherry 587 610 560 40 630 75 500-570 595-750
mCitrine 514 529 500 20 535 30 480-505 520-650
MitoTracker™ Deep Red 641 662 620 60 700 75 590-650 665-735
MitoTracker™ Green 490 512 470 40 525 50 400-480 500-600
MitoTracker™ Orange 551 575 550 20 590 30 450-550 570-700
MitoTracker™ Red 578 598 560 40 630 75 500-570 595-750
mKate2 588 633 560 40 630 75 500-570 595-750
mKO 549 559 530 30 575 40 450-540 555-700
mOrange2 551 565 530 30 575 40 450-540 555-700
mPlum 589 649 560 40 650 40 450-590 605-800
mRFP1 590 612 560 40 630 75 500-570 595-750
mTFP1 462 492 445 30 500 40 400-460 480-600
mWasabi 493 509 470 40 525 50 400-480 500-600
NBD-X (MeOH) 467 538 480 40 535 50 400-500 515-700
Nile blue 631 660 620 60 700 75 590-650 665-735
NirFP 604 669 600 40 670 40 580-620 650-800
Oregon Green™ 488 498 526 480 40 535 50 400-500 515-700
Oregon Green™ 514 513 532 500 20 535 30 480-505 520-650
Pacific Blue™ 404 455 405 20 460 50 350-410 430-550
Propidium Iodide (PI) 305 617 545 30 620 60 530-560 580-700
Pulsar™ 650 460 650 440 40 630 75 400-480 500-600
Qdot® 525 Nanocrystals 300 525 425 50 525 30 370-470 490-700
Qdot® 545 Nanocrystals 300 543 425 50 545 30 370-470 490-700
Qdot® 565 Nanocrystals 300 564 425 50 565 30 370-470 490-700
Qdot® 585 Nanocrystals 300 588 425 50 585 30 370-470 490-700
Qdot® 605 Nanocrystals 300 602 425 50 605 30 370-470 490-700
Qdot® 625 Nanocrystals 300 621 425 50 625 30 370-470 490-700
Qdot® 655 Nanocrystals 300 654 425 50 655 30 370-470 490-700
Qdot® 705 Nanocrystals 300 702 425 50 705 30 370-470 490-700
Qdot® 800 Nanocrystals 300 792 425 50 800 40 370-470 490-700
Quasar® 570 548 566 530 30 575 40 450-540 555-700
Quasar® 670 647 670 620 60 700 75 590-650 665-735
Quasar® 705 690 750 650 45 720 60 600-660 690-800
ReAsH-CCPGCC 592 606 560 40 630 75 500-570 595-750
Resorufin 571 584 545 20 590 30 450-550 570-700
Rhod-2 553 577 545 25 605 70 450-550 570-700
Rhodamine 123 507 529 500 20 535 30 480-505 520-650
Rhodamine 6G 525 547 500 40 560 50 450-510 530-700
Rhodamine Red-X 573 591 560 40 630 75 500-570 595-750
ROX 578 604 560 40 630 75 500-570 595-750
R-phycoerythrin 565 578 545 10 585 40 500-550 570-800
SBFI/Na+ -free 340 560 350 40 560 100 330-390 430-700
SBFI/Na+ -saturated 337 527 350 40 560 100 330-390 430-700
Sulforhodamine 101-EtOH 578 593 560 40 630 75 500-570 595-750
SYBR® Green I 498 522 480 40 535 50 400-500 515-700
SYTO 60 650 681 620 60 700 75 590-650 665-735
SYTO 9 483 500 470 40 525 50 400-480 500-600
TagBFP 402 457 405 20 460 50 350-410 430-550
TagRFP 556 584 545 25 605 70 450-550 570-700
TAMRA 555 580 545 25 605 70 450-550 570-700
tdTomato 554 581 545 25 605 70 450-550 570-700
TET 521 542 500 40 560 50 450-510 530-700
Tetracycline 405 550 405 40 550 60 350-460 480-650
Tetramethylrhodamine dextran 554 582 545 25 605 70 450-550 570-700
Texas Red® 592 614 560 40 630 75 500-570 595-750
TO-PRO™-3 642 657 620 60 700 75 590-650 665-735
TRITC 552 578 545 25 605 70 450-550 570-700
TurboFP650 592 650 560 40 630 75 500-570 595-750
wtGFP 474 509 450 50 525 50 370-470 490-700
X-Rhod-1 Indicator 580 601 560 40 630 75 500-570 595-750
ZsGreen1 493 505 470 40 525 50 400-480 500-600
ZsYellow1 529 539 500 40 560 50 450-510 530-700
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