qPCR における FAM とは何ですか?

qPCR における FAM とは何ですか?

FAM、または 6-カルボキシフルオレセインは、定量的ポリメラーゼ連鎖反応 (qPCR) アッセイで一般的に使用される蛍光色素です。これは、リアルタイム PCR アプリケーションで特定の DNA 配列を検出および定量化できるレポーター分子です。FAM は、ターゲット DNA 内の相補的 DNA 配列にハイブリダイズするプローブに付着します。プローブが損傷を受けていない場合、FAM の蛍光は消光されます。ただし、PCR プロセス中に、プローブは Taq ポリメラーゼの 5' から 3' エキソヌクレアーゼ活性によって分解され、FAM 色素が放出されて蛍光を発します。この蛍光はリアルタイムで測定でき、ターゲット DNA の初期量に関する定量情報を提供します。

qPCR における FAM の主な特徴:

• 蛍光レポーター: FAM は蛍光レポーター色素として機能し、励起されると緑色の蛍光を発します。通常、波長は 495 nm で、発光は 520 nm です。
• 定量化:蛍光信号の強度は標的 DNA の量に比例するため、定量分析が可能になります。
• 感度: FAM ラベル付きプローブは、ターゲット DNA 配列の検出において高い感度と特異性を提供します。
• 汎用性: FAM はほとんどの qPCR 機器と互換性があり、異なる発光スペクトルを持つ他の染料とのマルチプレックスアッセイに使用できます。

qPCR における FAM の応用:

• 遺伝子発現解析:特定の遺伝子の mRNA レベルを定量化し、さまざまな条件下での遺伝子発現を研究します。
• 遺伝子型判定:一塩基多型 (SNP) などの遺伝子変異を特定します。
• 病原体検出:サンプル内のウイルス、細菌、またはその他の微生物の DNA/RNA を検出し、定量化します。
• コピー数変異:異なるゲノムにわたる特定の遺伝子のコピー数の変動を評価します。