シアニン 3 とシアニン 5 の違いは何ですか?

シアニン3とシアニン5の違い

シアニン 3 (Cy3)とシアニン 5 (Cy5) はどちらも、さまざまな生物学的および化学的用途で検出目的で生体分子を標識するために使用される合成染料です。同じシアニン染料ファミリーに属していますが、化学構造と光学特性が異なるため、さまざまな用途に適しています。

化学構造

Cy3 と Cy5 のコア化学構造には、2 つの窒素含有複素環を連結するポリメチン橋が含まれます。主な違いは、ポリメチン橋の長さと複素環の置換基にあり、これがそれぞれの異なるスペクトル特性に寄与しています。

吸収と放出

• Cy3:吸収極大は通常 550 nm 付近、発光極大は 570 nm 付近 (可視スペクトル) で特徴付けられます。
• Cy5: 650 nm 付近に吸収極大があり、670 nm 付近に発光極大があります (近赤外線領域)。

アプリケーション

Cy3 は、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーなど、可視範囲での検出が必要な用途でよく使用されます。Cy5 は、吸収と発光波長が高いため、ウェスタンブロッティング、生体内イメージング、マルチプレックスアッセイなど、バックグラウンド蛍光が低い方が有利な用途に適しています。これらの用途では、Cy5 は、より波長の低い発光色素と一緒に使用できます。

光安定性

Cy3 染料と Cy5 染料はどちらも光安定性に優れていますが、光退色に対する耐性は、特定の用途や環境や照明強度などの条件によって異なります。実験でこの 2 つを選択する場合は、これらの要素を考慮することが重要です。

共役と反応性

コアシアニン構造に追加された化学基により、これらの染料は生体分子に結合することができます。Cy3 と Cy5 はどちらも、タンパク質、核酸、またはその他のターゲットに存在するさまざまな官能基 (アミン、チオール、カルボキシル基など) と反応するように変更することができます。

検出装置との互換性

Cy3 と Cy5 のどちらを選択するかは、検出装置で使用できるレーザーとフィルターによっても異なります。機器には、染料の特定のスペクトル特性に適した励起源と発光検出器が装備されている必要があります。

まとめ

Cy3 と Cy5 は蛍光標識に使用されるシアニン染料として類似点がありますが、吸収波長と発光波長が異なるため、さまざまな種類の蛍光ベースのアプリケーションに適しています。